Les inhibiteurs de la fonction HDX ciblent diverses voies de signalisation et mécanismes moléculaires pour obtenir leur effet inhibiteur. En entravant la signalisation mTOR, une classe d'inhibiteurs réduit la synthèse des protéines, un processus essentiel à l'activité de l'HDX. Cet effet est obtenu par l'inhibition de la signalisation médiée par la mTOR, qui est essentielle pour le rôle de l'HDX dans la synthèse des protéines. Une autre série d'inhibiteurs perturbe la voie PI3K/Akt/mTOR, dont dépend l'HDX pour une transduction efficace du signal, ce qui entraîne une diminution de l'activité de l'HDX. Les voies de l'inflammation et de la réponse au stress sont également ciblées, des inhibiteurs spécifiques bloquant la signalisation p38 MAPK et JNK, deux voies auxquelles l'HDX est connue pour participer. Par conséquent, l'activité de HDX est réduite en raison de la perturbation de ces voies. En outre, la voie ERK, essentielle à l'activation de l'HDX, est bloquée, ce qui inhibe encore davantage la fonction de l'HDX.
En outre, l'inhibition précise de la MEK empêche la signalisation en aval de la voie ERK, qui est une autre voie nécessaire à l'activation et à la fonction de l'HDX. Les inhibiteurs de la voie Akt jouent également un rôle important, car ils empêchent l'activation de l'HDX en bloquant la signalisation nécessaire à sa fonction. Cette voie est particulièrement importante pour le rôle du HDX dans les réponses cellulaires telles que la localisation membranaire. Au-delà des voies de signalisation, les inhibiteurs affectant la synthèse et la réparation de l'ADN, tels que ceux qui bloquent la synthèse de la pyrimidine, contribuent également à la diminution de l'activité de l'HDX, ce qui met en évidence l'étendue des voies biochimiques auxquelles l'HDX est associée. En outre, l'inhibition des récepteurs à tyrosine kinase et l'interférence avec le cycle cellulaire par l'inhibition de la kinase Aurora diminuent encore l'activité de l'HDX, ce qui démontre la diversité des approches utilisées pour inhiber la fonction de l'HDX par des moyens indirects mais efficaces.
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