La forskoline et l'ionomycine réquisitionnent les systèmes de second messager, en s'appuyant respectivement sur l'AMPc et les ions calcium. L'activation de l'adénylyl cyclase par la forskoline catalyse la conversion de l'ATP en AMPc, un messager essentiel dans la signalisation qui active la protéine kinase A (PKA), une kinase cruciale pour la phosphorylation des protéines cibles. L'ionomycine, en augmentant les niveaux de calcium intracellulaire, peut activer les kinases et les phosphatases dépendantes du calcium qui jouent un rôle essentiel dans la modification de l'activité des protéines. Le PMA imite le diacylglycérol, un activateur endogène de la protéine kinase C (PKC). La PKC phosphoryle un large éventail de protéines, modulant ainsi leurs fonctions. Des composés tels que la 5-azacytidine et la trichostatine A exercent une influence sur le mécanisme de régulation épigénétique. En inhibant les ADN méthyltransférases et les histones désacétylases, ces composés peuvent provoquer des changements importants dans l'expression des gènes, conduisant potentiellement à l'activation de protéines régulées au niveau transcriptionnel.
L'acide rétinoïque pénètre dans le noyau, où il se lie à ses récepteurs et influe sur l'expression des gènes, tandis que les inhibiteurs de petites molécules comme le SB 203580, le LY294002, le PD98059 et la rapamycine s'immiscent dans les voies de signalisation des kinases. Le SB 203580 bloque la MAP kinase p38, le LY294002 la PI3K, le PD98059 la MEK et la rapamycine la mTOR, toutes des voies clés dans le réseau complexe de la signalisation cellulaire qui régit l'activation des protéines.
La curcumine et le butyrate de sodium n'ont pas moins d'influence. La modulation de la voie NF-kB par la curcumine et l'inhibition de l'histone désacétylase par le butyrate de sodium peuvent toutes deux entraîner des modifications de l'activation des protéines.
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