Les inhibiteurs chimiques de la DUPD1 fonctionnent selon divers mécanismes pour moduler l'activité de la protéine en interférant avec différentes voies de signalisation et enzymes responsables de sa régulation. Le bisindolylmaleimide I, par exemple, est connu pour inhiber sélectivement la protéine kinase C (PKC), ce qui peut diminuer l'activité de la DUPD1 si la PKC est impliquée dans sa régulation. De même, la staurosporine, un inhibiteur non sélectif de la protéine kinase, peut inhiber largement les kinases susceptibles de phosphoryler et d'activer la DUPD1. D'autres inhibiteurs de kinases, comme le LY294002 et la wortmannine, ciblent spécifiquement les phosphoinositides 3-kinases (PI3K) qui, si elles font partie de la voie de régulation de DUPD1, conduiraient à une réduction de l'activation de la protéine. En outre, PD98059 et U0126, qui inhibent la protéine kinase activée par les mitogènes (MEK), et SB203580, un inhibiteur de la MAP kinase p38, peuvent diminuer l'activité de DUPD1 en empêchant les signaux de phosphorylation provenant de ces voies liées à la MAPK.
Dans le même ordre d'idées, le SP600125, qui inhibe la c-Jun N-terminal kinase (JNK), et le PP2, un inhibiteur des tyrosines kinases de la famille Src, peuvent réduire l'activité de la DUPD1 en bloquant les kinases respectives qui peuvent être nécessaires à son activation. La voie mTOR, une autre voie de régulation de nombreuses protéines, peut être inhibée par la rapamycine, ce qui pourrait entraîner une diminution de l'activité de la DUPD1. Le NF449, en inhibant sélectivement la sous-unité Gs alpha des protéines G, peut modifier la signalisation en aval susceptible d'affecter la DUPD1. Enfin, Y-27632, qui inhibe la protéine kinase associée à Rho (ROCK), peut entraîner une réduction de l'activité de DUPD1 si ROCK est impliqué dans la régulation des fonctions de DUPD1. Chacun de ces inhibiteurs cible des kinases ou des voies spécifiques qui, en cas d'inhibition, peuvent modifier l'état fonctionnel de DUPD1.
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