Inhibiteurs ATP11B

Les inhibiteurs courants de l'ATP11B comprennent, entre autres, la ouabaïne-d3 (majeure) CAS 630-60-4, la 12β-Hydroxydigitoxine CAS 20830-75-5, la thapsigargin CAS 67526-95-8, la brefeldine A CAS 20350-15-6 et la monensine A CAS 17090-79-8.

Les inhibiteurs chimiques de l'ATP11B peuvent entraver la fonction de la protéine par divers mécanismes, qui convergent tous vers l'inhibition de l'activité ATPase qui est au cœur de sa fonction. La ouabaïne et la digoxine, par exemple, exercent leur effet inhibiteur en ciblant spécifiquement la Na+/K+-ATPase, qui peut à son tour affecter indirectement l'ATP11B en raison de leur dépendance commune à l'égard des gradients ioniques qui sont cruciaux pour le maintien de l'activité de l'ATPase. Le bon fonctionnement de l'ATP11B repose sur le potentiel électrochimique à travers les membranes cellulaires, et la perturbation de ces gradients ioniques par l'ouabaïne et la digoxine peut inhiber son activité. La thapsigargin est un inhibiteur des pompes SERCA, ce qui entraîne une modification de l'homéostasie calcique; ce changement peut avoir un effet négatif sur l'ATP11B si la fonction de la protéine est régulée par la signalisation calcique. La Brefeldine A perturbe le trafic des protéines au sein de l'appareil de Golgi, ce qui peut entraver la localisation et la fonction correctes de l'ATP11B, car son fonctionnement peut dépendre d'un trafic cellulaire correct pour jouer son rôle.

En outre, le monensin, en tant qu'ionophore de sodium, perturbe les gradients ioniques, qui sont fondamentaux pour l'activité de l'ATP11B en tant qu'ATPase ionodépendante. Cette perturbation peut conduire à une inhibition fonctionnelle de l'ATP11B. Le vanadate agit comme un analogue du phosphate et peut déstabiliser le cycle de phosphorylation de l'ATP11B, inhibant son activité en perturbant la liaison et l'hydrolyse de l'ATP. L'oligomycine, bien que traditionnellement un inhibiteur des ATPases de type F, peut indirectement affecter l'ATP11B en perturbant les gradients de protons, qui sont potentiellement vitaux pour l'utilisation de l'énergie par l'ATP11B. L'azide interfère avec les ATPases en entravant le processus de phosphorylation, qui est essentiel pour l'hydrolyse de l'ATP par l'ATP11B. Le vérapamil, en tant qu'inhibiteur des canaux calciques, peut indirectement inhiber l'ATP11B si la protéine a besoin de niveaux de calcium finement ajustés pour fonctionner. Le fluorure de béryllium entre en compétition avec l'ATP sur le site actif de l'ATP11B, inhibant potentiellement la phosphorylation nécessaire à l'hydrolyse de l'ATP. La catéchine, connue pour inhiber les ATPases, peut se lier à l'ATP11B, interférant ainsi avec la liaison ou l'hydrolyse de l'ATP et inhibant la fonction de la protéine. Enfin, le N-Ethylmaléimide, qui alkyle les groupes thiols, peut modifier les résidus cystéine et inhiber les ATPases, ce qui pourrait affecter la fonction catalytique de l'ATP11B en modifiant son site actif.