Los inhibidores químicos del ZNF701 se dirigen a la funcionalidad de la proteína a través de diversas interacciones bioquímicas que impiden directamente su capacidad para operar como es debido dentro de los procesos celulares. El disulfiram interactúa con la ZNF701 por su capacidad de unirse a los dedos de zinc, que son fundamentales para la actividad de unión al ADN de la proteína. Esta unión interrumpe la interacción del ZNF701 con el ADN, inhibiendo así su función. El clotrimazol funciona según un principio similar: se une a los dominios de dedos de zinc del ZNF701, que son esenciales para su unión al ADN y su capacidad de regulación transcripcional, inhibiendo así la función de la proteína. El ebseleno introduce modificaciones en los residuos de cisteína del ZNF701, lo que puede dar lugar a cambios conformacionales que reducen la capacidad de la proteína para unirse al ADN, inhibiendo su función. El piritionato de zinc altera la homeostasis del zinc, que es necesario para el mantenimiento de los dominios de dedos de zinc de ZNF701 y, en consecuencia, su capacidad de unión al ADN.
La 1,10-fenantrolina y el clioquinol actúan como agentes quelantes que secuestran los iones de zinc, que son esenciales para la integridad estructural y la función de los dominios zinc finger del ZNF701. Esta quelación reduce eficazmente la capacidad de la proteína para unirse al ADN, inhibiendo así su función. El PDTC, de forma similar a los quelantes mencionados, se une a los iones de zinc y altera potencialmente los dominios de los dedos de zinc, que son esenciales para la función de unión al ADN del ZNF701. El tiludronato también se une a iones metálicos que podrían ser estructuralmente integrales para la función de los dominios zinc finger del ZNF701, provocando la inhibición de su actividad. Tanto el TPCA-1 como el triptolide inhiben el ZNF701 mediante la supresión de la activación de NF-κB, que es esencial para el papel del ZNF701 en la regulación de la expresión génica. El NSC 95397 inhibe la fosfatasa Cdc25, lo que puede conducir a la inhibición del ZNF701 al afectar al estado de fosforilación, suponiendo que la actividad del ZNF701 dependa de esta modificación postraduccional. Por último, el MG-132 se dirige al proteasoma, y la inhibición de este complejo puede conducir a la acumulación de proteínas reguladoras que pueden inhibir la actividad del ZNF701 debido a desequilibrios en las vías de señalización en las que participa el ZNF701.
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