ZBTB44 emplean diversos mecanismos para modular el estado de fosforilación y la actividad de esta proteína. La forskolina, al activar la adenilil ciclasa, aumenta la concentración intracelular de AMP cíclico, que a su vez activa la proteína cinasa A (PKA). La PKA, una cinasa crítica en numerosos procesos celulares, puede fosforilar la ZBTB44, alterando su función. De forma similar, el dibutiril-cAMP, un análogo del cAMP permeable a la membrana, activa la PKA y también puede fosforilar el ZBTB44. En una vía relacionada, el PMA activa la proteína cinasa C (PKC), otra cinasa con amplias funciones celulares, que puede fosforilar el ZBTB44. Tanto elapsigargina como la ionomicina elevan los niveles de calcio intracelular, pero a través de mecanismos diferentes. La capsigargina inhibe la bomba SERCA, lo que conduce a un aumento de los niveles de calcio citosólico, mientras que la ionomicina actúa como un ionóforo de calcio que aumenta directamente el calcio intracelular, lo que puede activar una serie de proteínas cinasas dependientes del calcio capaces de fosforilar ZBTB44.
Otras sustancias químicas actúan inhibiendo las fosfatasas, lo que a su vez provoca un aumento de los niveles de fosforilación de las proteínas celulares, incluida la ZBTB44. La caliculina A y el ácido okadaico son potentes inhibidores de las serina/treonina fosfatasas PP1 y PP2A, lo que provoca el mantenimiento del estado de fosforilación de sus proteínas sustrato. La cantaridina también inhibe estas fosfatasas, promoviendo un resultado similar. Otra capa de regulación es proporcionada por la anisomicina, que induce las proteínas quinasas activadas por el estrés, y aunque se conoce principalmente como un inhibidor de la síntesis de proteínas, puede conducir indirectamente a la fosforilación de ZBTB44. El piceatannol y la estaurosporina, aunque son inhibidores típicos de las quinasas, pueden provocar respuestas celulares compensatorias que activen vías alternativas que den lugar a la fosforilación de ZBTB44. La estaurosporina, especialmente a bajas concentraciones, puede activar de forma no selectiva quinasas que pueden tener como diana a ZBTB44. Por último, FTY720, tras ser fosforilado in vivo, modula los receptores de esfingosina-1-fosfato, lo que puede tener efectos descendentes que incluyen la activación de ZBTB44.
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