Los inhibidores químicos del PTGF-β actúan a través de diversos mecanismos para impedir las vías de señalización que son vitales para su función. SB-431542, LY2109761, Galunisertib y RepSox son inhibidores dirigidos contra los receptores de activina quinasa similares a receptores (ALK), que son componentes fundamentales de la vía de señalización del TGF-β. Al inhibir la actividad quinasa de ALK4, ALK5 y ALK7, estas sustancias químicas impiden la fosforilación de Smad2/3, un paso crucial en la transducción de la señal PTGF-β. Por ejemplo, el galunisertib bloquea la fosforilación y activación de las proteínas Smad2/3 mediante la inhibición de la actividad cinasa de ALK5, reduciendo directamente la actividad funcional de la señalización de PTGF-β. Del mismo modo, RepSox se dirige al dominio quinasa ALK5, lo que provoca un obstáculo en la vía TGF-β/Smad e inhibe así la actividad de PTGF-β.
Más abajo en la vía de señalización del PTGF-β, sustancias químicas como la Pirfenidona y el Tranilast actúan atenuando la señalización del TGF-β, pero a través de un mecanismo diferente. Estos inhibidores actúan obstruyendo la fosforilación corriente abajo de Smad2/3, que es esencial para la transmisión de señales mediadas por PTGF-β. Tranilast, en concreto, interrumpe la translocación nuclear de Smad2/3, lo que resulta en un bloqueo de los efectos de PTGF-β dentro de la célula. Otros inhibidores, como LY364947 y GW788388, también inhiben eficazmente la actividad quinasa de ALK5, y GW788388 extiende su inhibición a ALK4. Esta inhibición dual por GW788388 deteriora fuertemente la fosforilación de Smad2/3 inducida por TGF-β, culminando en una inhibición funcional sustancial de PTGF-β. SD-208, A83-01 y Vactosertib también inhiben selectivamente ALK5, ALK4 y ALK7 en distinta medida, lo que se traduce en la supresión de la señalización TGF-β/Smad y la inhibición funcional de PTGF-β.
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