Los inhibidores enumerados anteriormente se dirigen principalmente a procesos anteriores a la poliadenilación, como la transcripción y el procesamiento del ARN, que podrían influir indirectamente en la actividad de PAP-α. Dado el papel crítico de PAP-α en la maduración del ARN, la modulación de estos procesos previos es relevante para comprender su función y su posible regulación. La cordicepina y la actinomicina D pueden afectar directamente a la síntesis y el procesamiento del ARN, lo que podría influir en los sustratos disponibles para PAP-α. La α-manitina, el DRB y los compuestos inhibidores de la ARN polimerasa II o III disminuirían la síntesis de sustratos de ARN para PAP-α.
Flavopiridol y Triptolide, al inhibir factores implicados en la elongación e iniciación transcripcional, podrían afectar indirectamente a la actividad de PAP-α. Leptomicina B y Selinexor, al afectar a la exportación nuclear, podrían influir indirectamente en la dinámica de los sustratos de ARN procesados por PAP-α. El CX-5461, al inhibir la ARN polimerasa I, podría influir en la síntesis del ARN ribosómico, afectando así indirectamente al papel de PAP-α en el procesamiento del ARNm. Los inhibidores del espliceosoma, como la meayamicina B y el pladienólido B, podrían influir en la maduración de los sustratos de ARNpre-m para PAP-α.
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