Los inhibidores químicos de Med18 pueden ejercer sus efectos inhibidores a través de diversos mecanismos que alteran su función dentro del complejo mediador, un componente crítico en la regulación de la transcripción génica. La tricostatina A, por ejemplo, inhibe las histonas desacetilasas, lo que conduce a la hiperacetilación de las histonas; este cambio puede impedir las capacidades de reclutamiento y las actividades de regulación transcripcional de Med18. Del mismo modo, el flavopiridol se dirige a las cinasas dependientes de ciclinas, cuya actividad es necesaria para la fosforilación de las subunidades del complejo mediador; la inhibición de estas cinasas puede reducir la competencia funcional de Med18 en el proceso de transcripción. El ICG-001 se une selectivamente a la proteína de unión a CREB, perturbando posiblemente su interacción con el complejo mediador e influyendo así en la actividad de Med18. La triptolida, al inhibir la ARN polimerasa II, puede impedir el papel de Med18 en la facilitación transcripcional, ya que forma parte del complejo que ayuda a Pol II.
Además, el inhibidor químico DRB se dirige a CDK9 y CDK12, que fosforilan la ARN Polimerasa II, y su inhibición puede impedir que Med18 participe eficazmente en la elongación de la transcripción. El silvestrol, al inhibir el factor de iniciación eIF4A, puede disminuir la síntesis de Med18, lo que conduce a su inhibición funcional. El H-89, un inhibidor de la quinasa, podría impedir la fosforilación de los componentes del complejo mediador, afectando al estado operativo de Med18. El C646, mediante la inhibición de la acetiltransferasa p300, puede reducir los niveles de acetilación de Med18 o de sus factores asociados, lo que es crítico para su función de regulación transcripcional. El bortezomib, mediante la inhibición del proteasoma, puede inhibir indirectamente a Med18 secuestrando ubiquitina ligasas o cofactores esenciales para su actividad. La inhibición de las CDK por SNS-032 puede reducir la fosforilación necesaria de Med18, impidiendo su función transcripcional. MG-132 puede causar una acumulación de proteínas mal plegadas, lo que lleva a una respuesta de estrés celular que puede incluir la inhibición de Med18. Por último, la inhibición por JQ1 de las proteínas BET bromodominio puede interferir con el reclutamiento de Med18 a la cromatina acetilada, inhibiendo así su actividad transcripcional.
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