Los inhibidores químicos de la GMPR1 actúan interrumpiendo varias etapas de la vía del metabolismo de las purinas, lo que dificulta la función de la enzima. El alopurinol actúa inhibiendo la xantina oxidasa, que es esencial para la conversión de hipoxantina en xantina y de xantina en ácido úrico, pasos previos a la actividad de la GMPR1. Esto reduce la reserva de derivados de guanina disponibles para la GMPR1, impidiendo así su acción. Del mismo modo, el micofenolato y su forma activa, el ácido micofenólico (MPA), actúan sobre la inosina monofosfato deshidrogenasa (IMPDH), una enzima responsable de convertir la inosina monofosfato en xantina monofosfato, el precursor inmediato del GMP. Al inhibir la IMPDH, estas sustancias químicas limitan el suministro de GMP, necesario para que GMPR1 funcione eficazmente. La ribavirina, como análogo de la guanosina, compite con el GMP por el sitio activo de la GMPR1, inhibiendo así la conversión de GMP en IMP.
Las acciones del metotrexato, la 6-mercaptopurina y la tioguanina también afectan a la actividad de la GMPR1 al reducir la síntesis o la disponibilidad de su sustrato. La inhibición de la dihidrofolato reductasa por el metotrexato provoca una disminución de la síntesis de purinas y, por consiguiente, de los niveles de GMP. Tanto la 6-mercaptopurina como la tioguanina se metabolizan en compuestos que imitan al GMP y actúan como sustratos fraudulentos para el GMPR1, impidiendo así que la enzima procese su sustrato genuino. El aciclovir y el AZT, cuando se fosforilan, se parecen al GMP y actúan como inhibidores competitivos, uniéndose al GMPR1 e impidiendo el procesamiento del GMP. La clofarabina y la fludarabina, ambos análogos de nucleósidos de purina, al fosforilarse inhiben la ribonucleótido reductasa, reduciendo las reservas de desoxirribonucleótidos, incluida la de dGMP, lo que a su vez limita la disponibilidad de GMP para GMPR1. Por último, la cladribina, en su forma activa de trifosfato, interrumpe las enzimas de la vía de síntesis del ADN, lo que provoca un agotamiento del dGTP y la consiguiente disminución de los niveles de GMP, inhibiendo así indirectamente el GMPR1. Cada una de estas sustancias químicas, al dirigirse a vías y procesos específicos, deteriora la funcionalidad de la GMPR1, estableciendo una red de inhibición que converge en esta enzima metabólica fundamental.
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