RNase 12 Aktivatoren

Gängige RNase 12 Activators sind unter underem Magnesium chloride CAS 7786-30-3, Spermidine CAS 124-20-9, Sodium Chloride CAS 7647-14-5, Ammonium Sulfate CAS 7783-20-2 und Urea CAS 57-13-6.

Die RNase 12, von der man annimmt, dass sie eine aktive Ribonuklease ist, funktioniert in einem komplexen biochemischen Kontext, in dem ihre Aktivität von einer Vielzahl kleiner Moleküle und Ionen beeinflusst wird. Die katalytische Wirkung von RNase 12 hängt in hohem Maße von zweiwertigen Kationen ab, die für die Fähigkeit des Enzyms, RNA durch Stabilisierung des reaktiven Zwischenprodukts zu spalten, unerlässlich sind. Darüber hinaus wird die enzymatische Effizienz in Umgebungen, die mit bestimmten einwertigen Kationen und polyatomaren Ionen angereichert sind, deutlich erhöht. Diese Ionen können die negativen Ladungen der RNA abschwächen und so eine effektivere Interaktion zwischen der RNase 12 und ihren Ziel-RNA-Molekülen fördern. Insbesondere das Vorhandensein von Kaliumionen kann die dreidimensionale Struktur des Enzyms beeinflussen, was sich möglicherweise auf die Substratbindung und die katalytische Rate auswirkt.

Abgesehen von diesen ionischen Effekten tragen verschiedene organische Verbindungen wesentlich zur Regulierung der Funktionalität von RNase 12 bei. Bestimmte kleine Moleküle sind in der Lage, die auf Ladungen basierende Abstoßung entlang der RNA-Kette zu verringern, wodurch die Interaktion des Enzyms mit seinen Substraten verbessert und seine Aktivität gesteigert wird. Außerdem können mehrwertige Alkohole und einfache Alkohole zur Stabilisierung der aktiven Form des Enzyms beitragen und damit seine katalytische Wirkung verstärken. Darüber hinaus können bestimmte Chaotrope die Konformation des Proteins auf subtile Weise verändern; bei RNase 12 könnten diese Veränderungen zu einer größeren Freilegung des aktiven Zentrums führen, wodurch die Verfügbarkeit von Substraten für die Spaltung erhöht und die Gesamtaktivität gesteigert wird.