Chemische Inhibitoren von H2-Q10 können in verschiedene zelluläre Prozesse eingreifen, die für seine Funktion bei der Antigenpräsentation wesentlich sind. Brefeldin A stört den Transport von Proteinen, indem es den ADP-Ribosylierungsfaktor hemmt, der für den vesikulären Transport zwischen dem endoplasmatischen Retikulum und dem Golgi-Apparat erforderlich ist. Diese Wirkung kann die ordnungsgemäße Reifung und Lokalisierung von H2-Q10 behindern. In ähnlicher Weise stört Monensin als Ionophor das Natrium- und Kalziumgleichgewicht in den Zellen, was auch die endosomalen und lysosomalen Wege beeinträchtigen kann, die für die Peptidbeladung von H2-Q10 entscheidend sind. Sowohl Chloroquin als auch Curcumin wirken, indem sie den pH-Wert in Endosomen und Lysosomen anheben, also in Umgebungen, in denen H2-Q10 normalerweise Antigene bindet. Der erhöhte pH-Wert kann die Antigenverarbeitung behindern, die für die Rolle von H2-Q10 unerlässlich ist.
Colchicin hat weitere Auswirkungen auf H2-Q10 und greift das Zytoskelett an, indem es an Tubulin bindet und dessen Polymerisation verhindert. Diese Wirkung kann die Funktionen des Zytoskeletts stören, darunter auch den Transport und die Präsentation von Antigenen durch H2-Q10. Inhibitoren wie Bafilomycin A1 und Concanamycin A wirken spezifisch auf die vakuoläre H+-ATPase und verhindern so die Ansäuerung von Organellen wie Endosomen und Lysosomen, die für die Antigenverarbeitung durch H2-Q10 unerlässlich ist. Die Hemmung der Proteinsynthese ist eine weitere Strategie von Emetin, das die ribosomale Bewegung entlang der mRNA blockiert und so möglicherweise die Produktion von H2-Q10 und der Peptide, die es präsentiert, verhindert. Die Proteolyse, die für die Erzeugung von Peptiden zur Präsentation von H2-Q10 notwendig ist, kann durch Leupeptin, das auf Cystein- und Serinproteasen abzielt, und durch Proteasominhibitoren wie MG-132, Lactacystin und Epoxomicin gehemmt werden. Diese Inhibitoren verhindern gemeinsam den Abbau von Proteinen in Peptide, die für die H2-Q10-Beladung geeignet sind, und hemmen so effektiv die Antigen-präsentierende Funktion.
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