Chemische Inhibitoren des Wachstumsdifferenzierungsfaktors 3 (GDF-3) wirken über verschiedene Mechanismen, um die Signalwege zu modulieren, die GDF-3 für seine biologische Funktion nutzt. Dorsomorphin und sein Analogon LDN-193189 z. B. greifen selektiv in den BMP-Signalweg ein, einen entscheidenden Weg, über den GDF-3 seine Wirkung entfaltet. Diese Inhibitoren wirken, indem sie die Aktivität von BMP-Rezeptoren des Typs I direkt behindern, die Phosphorylierung und anschließende Aktivierung von SMAD-Proteinen vereiteln und dadurch die nachgeschaltete Signalübertragung hemmen, die in der Regel durch GDF-3 ausgelöst wird. Ein weiterer Wirkstoff, SB-431542, hemmt selektiv die aktivinrezeptorähnlichen Kinasen (ALK) innerhalb des TGF-beta-Signalwegs. Da GDF-3 zur TGF-beta-Superfamilie gehört, unterbricht die Hemmung dieser Kinasen durch SB-431542 die Signaltransduktion, an der GDF-3 normalerweise beteiligt wäre.
DMH1 und K02288 dienen ebenfalls als selektive BMP-Rezeptor-Inhibitoren und stören damit die BMP-Signalkaskade, an der GDF-3 beteiligt ist. In ähnlicher Weise hemmt LDN-214117 die Rezeptoren ALK2 und ALK3, mit denen GDF-3 interagieren kann, und reduziert damit funktionell die GDF-3-Signalübertragung. A 83-01 erweitert diese hemmende Wirkung, indem es auf ALK5 und ALK7 sowie auf TGF-beta-Typ-I-Rezeptoren abzielt und so die Signalkapazitäten von GDF-3 weiter einschränkt. ML347, LDN-212854 und DMH2 spielen ebenfalls eine Rolle bei der Hemmung von BMP-Typ-I-Rezeptoren wie ALK1, ALK2, ALK3 und ALK6, die integrale Bestandteile der von GDF-3 genutzten Signalwege sind. ALK5 Inhibitor II zielt spezifisch auf den TGF-beta Typ I Rezeptor ALK5, der integraler Bestandteil der GDF-3 Signalwege ist. Schließlich unterbricht Alantolacton die Aktivität von GDF-3, indem es die SMAD3-Phosphorylierung hemmt, ein Schlüsselereignis in den nachgeschalteten Signalwegen der TGF-beta-Superfamilie, zu der GDF-3 gehört.
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