Klasse-II-Transaktivator-Aktivatoren bestehen aus verschiedenen chemischen Verbindungen, die die Expression und Aktivität von CIITA beeinflussen können, das die Transkription der für die Antigenpräsentation notwendigen MHC-Klasse-II-Gene koordiniert. Wirkstoffe wie Amlexanox und Pyrimethamin verstärken indirekt die CIITA-Aktivität, indem sie die Aktivität von Kinasen und Enzymen modulieren, die an Stoffwechsel- und Signalwegen beteiligt sind, welche die direkt für die CIITA-Expression verantwortlichen Transkriptionsfaktoren beeinflussen. Die Hemmung der Kinasen IKK-epsilon und TBK1 durch Amlexanox führt zur Aktivierung von IRF3, einem Transkriptionsfaktor, von dem bekannt ist, dass er CIITA hochreguliert. Die Hemmung der Dihydrofolatreduktase durch Pyrimethamin kann zur Anhäufung von Metaboliten führen, die als Kofaktoren für Transkriptionsfaktoren fungieren und dadurch die Expression von CIITA verstärken.
Chemikalien wie Chloroquin und Rolipram wirken sich auf die endosomale Signalübertragung bzw. auf den Spiegel von zyklischem AMP (cAMP) aus, was zur Aktivierung von Signalwegen führt, an denen NF-kB beteiligt ist, ein bekannter Regulator der CIITA-Transkription. Chloroquin unterbricht die endosomale Ansäuerung, was sich auf die TLR-Signalübertragung und die daraus resultierende NF-kB-Aktivierung auswirkt, während die Hemmung der Phosphodiesterase 4 durch Rolipram den cAMP-Spiegel erhöht, wodurch PKA aktiviert wird und letztlich die CIITA-Transkription verstärkt werden kann. Epigenetische Modifikatoren wie 5-Azacytidin und Trichostatin A spielen ebenfalls eine Rolle, indem sie den CIITA-Promotor demethylieren oder die Histonacetylierung erhöhen, was zu einem offenen Chromatinzustand führt, der die Transkription begünstigt. Die Aktivierung von SIRT1 durch Resveratrol und die Wirkung von Sulforaphan und Oltipraz auf Nrf2 zeigen, wie die Veränderung der Aktivität von Transkriptionsfaktoren und Kernrezeptoren indirekt die CIITA-Expression fördern kann.
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