EDEM3-Inhibitoren als theoretische chemische Klasse würden Verbindungen umfassen, die entweder direkt die Mannose-Trimming-Aktivität von EDEM3 hemmen oder die Fähigkeit des ERAD-Stoffwechsels zur Verarbeitung fehlgefalteter Glykoproteine modulieren. Da eine direkte Hemmung von EDEM3 nicht nachgewiesen werden konnte, sind die aufgeführten Chemikalien diejenigen, die die mit der EDEM3-Funktion verbundenen Wege und Prozesse beeinflussen können. Unter den indirekten Inhibitoren zielen Kifunensin, Swainsonin, Castanospermin und 1-Deoxynojirimycin auf verschiedene Aspekte der Glykanverarbeitung ab. Durch die Hemmung spezifischer Mannosidasen oder Glucosidasen können diese Verbindungen die Glykoproteinreifung verändern und damit die Substrate beeinflussen, die EDEM3 normalerweise erkennt und verarbeitet. Diese Veränderung kann zu einer Anhäufung von fehlgefalteten Proteinen führen, die die Kapazität des ERAD-Stoffwechsels in Frage stellen und indirekt die Aktivität von EDEM3 beeinflussen.
Proteostasemodulatoren wie MG132 und Eeyarestatin I können zu einer Anhäufung ubiquitinierter Proteine führen, was den ER-Stress verschlimmert und indirekt die Funktion von EDEM3 innerhalb des ERAD-Wegs belastet. Tunicamycin und Brefeldin A stören die Glykosylierung und den Transport von Proteinen zwischen dem ER und dem Golgi-Apparat, was zu einer erhöhten Belastung durch fehlgefaltete Proteine führen kann, die einen EDEM3-vermittelten Abbau erfordern würden. Inhibitoren von EDEM3 wären Verbindungen, die seine Funktion im ERAD-Weg beeinträchtigen können, entweder durch direkte Hemmung seiner Mannosidase-ähnlichen Aktivität oder durch Beeinflussung des Abbauprozesses von fehlgefalteten Glykoproteinen. Da es jedoch keine spezifischen Inhibitoren gibt, können wir Chemikalien in Betracht ziehen, die den ERAD-Weg oder die Proteinfaltung und -abbaumechanismen im endoplasmatischen Retikulum (ER) beeinflussen.
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