DDX10 Inhibitoren

Gängige DDX10 Inhibitors sind unter underem Aurintricarboxylic Acid CAS 4431-00-9, Ethidium bromide CAS 1239-45-8, Heparin CAS 9005-49-6, Novobiocin CAS 303-81-1 und Berberine CAS 2086-83-1.

Chemische Inhibitoren von DDX10 nutzen verschiedene Mechanismen, um die Helikaseaktivität dieses Proteins zu hemmen. Novobiocin zielt auf die ATPase-Domäne von DDX10 ab und behindert die ATP-Bindung und die anschließende Helikase-Aktivität. Suramin kann durch Wechselwirkung mit Nukleotiden und Nukleinsäuren DDX10 hemmen, indem es die Fähigkeit des Enzyms zur ATP-Hydrolyse unterbricht. Aurintricarbonsäure hemmt die Interaktion zwischen DDX10 und seinem RNA-Substrat, indem sie an die Nukleinsäure-Bindungsstellen auf DDX10 bindet und so die funktionelle Interaktion des Proteins mit der RNA unterbindet.

Ethidiumbromid, Berberin, Amsacrin, Daunorubicin, Mitoxantron und Actinomycin D wirken alle durch Interferenz mit den Nukleinsäuren, mit denen DDX10 interagieren soll. Ethidiumbromid und Berberin lagern sich in Nukleinsäuren ein und verändern die Struktur von RNA oder DNA, wodurch DDX10 daran gehindert wird, sein Substrat zu binden oder abzuwickeln. Diese strukturelle Veränderung der Nukleinsäuren durch interkalierende Wirkstoffe stellt eine Barriere für die Helikaseaktivität von DDX10 dar. Oxaliplatin bildet DNA-Addukte, die Querverbindungen innerhalb der DNA schaffen, die von der Helikasefunktion von DDX10 nicht überwunden werden können und somit seine Aktivität hemmen. Actinomycin D bindet an die DNA und blockiert die Transkriptions- und Interaktionsstellen, wodurch sie für DDX10 unzugänglich werden und die Abwicklungsfunktion der Helikase verhindert wird. Heparin ist zwar in erster Linie für seine gerinnungshemmenden Eigenschaften bekannt, besitzt aber auch die Fähigkeit, an Proteine zu binden, die mit Nukleinsäuren interagieren; es kann an DDX10 binden und das Protein sterisch daran hindern, mit seinen Nukleinsäuresubstraten in Kontakt zu treten, wodurch die Helikaseaktivität gehemmt wird.