ZNF543は、様々な細胞内シグナル伝達経路を通じてその活性を誘導することができる。フォルスコリンは、細胞内のサイクリックAMP(cAMP)レベルを上昇させることにより、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、ZNF543をリン酸化して活性化することができる。このメカニズムはイソプロテレノールとジブチリル-cAMPでも同様で、どちらもcAMPレベルを上昇させ、その後PKAを活性化し、ZNF543のリン酸化状態を高める。上皮成長因子(EGF)は、その受容体EGFRに結合し、MAPK/ERK経路を活性化するカスケードを開始し、ZNF543のリン酸化と活性化に至るという、異なるメカニズムで作用する。フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)は、ZNF543を含む様々な基質をリン酸化し、その活性を変化させることができるもう一つのキナーゼであるプロテインキナーゼC(PKC)を刺激する。
ZNF543の活性化には、細胞内カルシウムレベルの変化によって媒介されるものも含まれる。イオノマイシンは細胞内のカルシウム濃度を上昇させ、ZNF543を修飾することができるカルシウム依存性キナーゼを活性化することができる。ブラジキニンもまた、Gタンパク質共役型レセプターを介して細胞内カルシウム濃度を上昇させ、それに続いてイノシトール三リン酸(IP3)が産生され、ZNF543の活性化につながる可能性がある。インスリンは様々なタンパク質をリン酸化するPI3K/Akt経路を引き起こし、おそらくZNF543の修飾につながる。塩化リチウムはGSK-3βを阻害することで間接的に作用し、Wntシグナル伝達経路に影響を与え、おそらくZNF543の活性化につながる。酪酸ナトリウムはクロマチン構造を変化させ、ZNF543のDNA結合能力を高める可能性がある。最後に、カリクリンAは、ZNF543のようなタンパク質を脱リン酸化することが知られているタンパク質リン酸化酵素を阻害することによって、タンパク質のリン酸化状態を維持するのを助ける。
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