ZNF253の化学的阻害剤には、このタンパク質の機能的活性に間接的に関与する様々なシグナル伝達経路や酵素を標的とする様々な化合物が含まれる。WortmanninとLY294002は、ホスファチジルイノシトール3キナーゼ(PI3K)を阻害し、AKTのリン酸化を低下させる例である。AKTは活性化されると、ZNF253を含む多くのタンパク質の生存と活性に不可欠なシグナルを伝播するキナーゼである。AKT活性を低下させることにより、これらの阻害剤はZNF253の機能を抑制することができる。ラパマイシンは、タンパク質合成と細胞増殖を制御する経路の中心的タンパク質であるmTOR(mammalian target of rapamycin)を標的とすることで阻害作用を発揮する。mTORはZNF253が機能する細胞環境に影響を与えるので、その阻害はZNF253の活性を抑制すると考えられる。
さらに、PD98059とU0126のような阻害剤は、それぞれMEK1とMEKを阻害することによって、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ/細胞外シグナル調節キナーゼ(MAPK/ERK)経路を標的とする。この経路は、ZNF253を含むタンパク質の機能制御に必要な細胞増殖と分化シグナルに重要である。この経路を阻害することにより、ZNF253の活性を抑制することができる。さらに、Srcファミリーキナーゼ阻害剤PP2は、ZNF253の活性に不可欠なシグナル伝達経路を破壊する可能性がある。それぞれp38 MAPKとc-Jun N末端キナーゼ(JNK)を阻害するSB203580とSP600125は、ZNF253の機能に影響を与えうる他のMAPK経路を標的としている。これらのキナーゼの阻害は、ZNF253の活性に寄与するシグナル伝達を減少させると考えられる。Y-27632はRho-associated protein kinase(ROCK)を標的としており、ROCKは細胞骨格形成に関与している。細胞骨格の動態が変化すると、ZNF253の機能に不可欠なシグナル伝達メカニズムが阻害される可能性がある。PD173074とSU5402はともに線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)チロシンキナーゼの阻害剤であり、ZNF253の活性に必要な上流のシグナル伝達を阻害する可能性がある。最後に、プロテインキナーゼC(PKC)阻害剤であるChelerythrineは、ZNF253の活性に必要な基質のリン酸化を阻害し、その機能を阻害する可能性がある。
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