WDR65阻害剤には、様々なシグナル伝達経路や細胞プロセスに影響を与えることにより、WDR65の機能的活性を制約する様々な化合物が含まれる。広範なキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、キナーゼを介するシグナル伝達を非特異的に阻害するため、これらの経路におけるWDR65の機能的要件を低下させる可能性がある。同様に、PI3K阻害剤LY 294002とWortmanninは、二重PI3K/mTOR阻害剤GSK2126458とともに、WDR65の細胞内での役割に重要である可能性のある経路であるPI3K/ACTシグナル伝達を減少させることにより、WDR65活性を低下させる可能性がある。MAPK経路のERK活性化を抑制する特異的なMEK阻害剤PD 98059、U0126、コビメチニブも、もしWDR65がERKを介する過程に関与していれば、WDR65の活性低下につながる可能性がある。AKTを標的とするTriciribineとmTOR阻害剤であるRapamycinは、それぞれの阻害作用を通じてWDR65の機能低下の可能性にさらに寄与している。
上記に加えて、ボルテゾミブのプロテアソーム阻害作用は、細胞恒常性の全般的な乱れにつながり、間接的にWDR65の機能的能力に影響を及ぼす可能性がある。SP600125が標的とするJNK経路とSB 203580が標的とするp38 MAPKは、いずれも細胞のストレス反応に関連している。もしWDR65がこれらのストレス関連シグナル伝達経路に関与していれば、これらの経路の阻害によってWDR65の活性が低下する可能性がある。これらのような阻害剤は、WDR65が機能的に統合されていると思われるシグナル伝達分子や経路の活性を抑制することにより、潜在的なシグナル伝達中間体やモジュレーターを破壊することで間接的にタンパク質の活性を阻害する多面的なアプローチを提供する。
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