VPS36 (Vacuolar Protein Sorting-associated protein 36) è una componente integrale del complesso ESCRT-II (Endosomal Sorting Complex Required for Transport II), essenziale per lo smistamento delle proteine di membrana ubiquitinate nelle vescicole interne dei corpi multivescicolari (MVB). Il complesso ESCRT-II, che include VPS36, è coinvolto nel riconoscimento e nel sequestro delle proteine ubiquitinate nella membrana endosomiale. VPS36 si lega specificamente all'ubiquitina attraverso il suo dominio GLUE (GRAM-like ubiquitin-binding in Eap45), una caratteristica unica che lo distingue dagli altri componenti ESCRT. Questa interazione è fondamentale per la funzione di smistamento di ESCRT-II.
VPS36 è anche coinvolto nelle fasi finali della citocinesi e nel processo di abscissione, in cui avviene la separazione finale delle cellule figlie dopo la mitosi. Inoltre, svolge un ruolo nella replicazione e nella patogenesi di vari virus, in quanto molti di essi dirottano il macchinario ESCRT per gemmare dalla membrana della cellula ospite. La disfunzione del macchinario ESCRT, compreso VPS36, può portare a malattie come i disturbi neurodegenerativi, il cancro e le infezioni virali. La regolazione precisa di VPS36 e del complesso ESCRT-II è quindi fondamentale per mantenere l'omeostasi cellulare.
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