Los activadores de SCML1 funcionan en gran medida a través de su influencia en los procesos de remodelación de la cromatina. SCML1 forma parte del complejo del grupo Polycomb (PcG), que participa directamente en la represión transcripcional a través de la remodelación de la cromatina. Este complejo ejerce su función modificando la estructura de la cromatina, y cualquier cambio en el estado de la cromatina puede influir directamente en la actividad de SCML1. Por ejemplo, la tricostatina A, el ácido suberanilohidroxámico (SAHA), Scriptaid, Oxamflatin,MS-275, MC1568 y el butirato sódico, todos ellos inhibidores de la histona desacetilasa, promueven la acetilación de las histonas, lo que conduce a un estado relajado de la cromatina que puede potenciar la actividad funcional de SCML1. De forma similar, el BIX-01294, un inhibidor de la histona metiltransferasa G9a, puede provocar una disminución de la metilación de las histonas, promoviendo la remodelación de la cromatina y, en consecuencia, potenciando la actividad funcional de SCML1.
Un segundo grupo de activadores de SCML1, que incluye la 5-azacitidina, la 5-aza-2'-desoxicitidina y el RG108, son inhibidores de la ADN metiltransferasa. Estos compuestos provocan la desmetilación del ADN, otra forma de remodelación de la cromatina, que puede potenciar la actividad funcional de SCML1. La mitramicina A, un antibiótico que se une al ADN, es otro activador de SCML1. Al interferir con la unión del factor de transcripción al ADN, altera la expresión génica y puede activar indirectamente la SCML1.
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