A categoria de compostos denominados inibidores da PREP-1 inclui vários produtos químicos que visam indiretamente ou influenciam a atividade da PREP-1 (proteína reguladora de Pbx 1). Estes inibidores funcionam modulando as vias de transcrição, a estrutura da cromatina ou os padrões de metilação do ADN, em vez de se ligarem diretamente ou inibirem a PREP-1. O principal mecanismo através do qual estes inibidores exercem os seus efeitos envolve a modulação de processos celulares que regulam a expressão genética. Compostos como o ácido retinóico, a 5-azacitidina e a decitabina afectam os factores de transcrição e os padrões de expressão genética, o que pode afetar indiretamente a função do PREP-1 no desenvolvimento e na diferenciação celular. Os inibidores da histona desacetilase, como a tricostatina A e o vorinostato, podem alterar a estrutura da cromatina, influenciando as actividades de transcrição em que o PREP-1 está envolvido.
O BIX-01294 e o RG108, ao inibirem a metilação das histonas e do ADN, respetivamente, podem alterar os perfis de expressão dos genes, afectando os papéis reguladores do PREP-1. O JQ1 e o I-BET151 têm como alvo os bromodomínios BET, componentes da cromatina que são críticos para a regulação da expressão genética, o que poderia influenciar indiretamente a atividade da PREP-1. O dissulfiram, através dos seus efeitos na atividade do proteassoma, pode afetar indiretamente o PREP-1 ao influenciar a estabilidade de proteínas envolvidas na regulação da transcrição. O A-485 e o C646, como inibidores da histona acetiltransferase p300/CBP, poderiam também afetar a função do PREP-1 através da modulação do estado de acetilação das histonas e dos factores de transcrição.
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