Os inibidores químicos da N4bp2l1 utilizam vários mecanismos para interferir com a função normal desta proteína. A estaurosporina actua através da obstrução das proteínas cinases que são fundamentais para a fosforilação dos substratos que interagem com a N4bp2l1, levando à sua inibição. O mesmo acontece com a Wortmannin e o LY294002, que têm como alvo as fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K). Ao inibir a PI3K, estes compostos podem perturbar as vias de sinalização da fosforilação, essenciais para a atividade da N4bp2l1. O PD98059 e o U0126 impedem a proteína quinase activada por mitogénio (MEK), que se situa a montante de várias cascatas de sinalização. A inibição da MEK leva à redução da fosforilação de proteínas a jusante que podem incluir ou regular a N4bp2l1, diminuindo assim a atividade da N4bp2l1.
Além disso, o SP600125 e o SB203580 inibem especificamente a c-Jun N-terminal kinase (JNK) e a p38 MAP kinase, respetivamente. Estas cinases fazem parte de vias de sinalização que podem contribuir para o estado funcional da N4bp2l1, e a sua inibição pode resultar numa redução da atividade da N4bp2l1. Por outro lado, sabe-se que a PP2 e o Dasatinib têm como alvo as tirosina-quinases. A PP2 inibe as tirosina-quinases da família Src, enquanto o Dasatinib é um inibidor de tirosina-quinases de espetro mais alargado, levando ambos à supressão de vias que envolvem a fosforilação da tirosina de proteínas que envolvem a N4bp2l1. Além disso, a rapamicina actua na via mTOR, que está ligada à síntese proteica e pode afetar indiretamente as proteínas que regulam a N4bp2l1. Por último, o Bortezomib e o MG132, ambos inibidores do proteassoma, podem levar a uma acumulação de proteínas mal dobradas, potencialmente perturbando os processos celulares e as vias que incluem a N4bp2l1, inibindo assim a sua função. Estes inibidores químicos elucidam coletivamente a complexa rede de interacções reguladoras e vias de sinalização que regem a atividade da N4bp2l1.
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