化学クラスの説明I-SceI阻害剤のクラスは、I-SceIが相互作用するDNA基質に影響を与えることにより、間接的にI-SceIの活性を調節する化合物からなる。これらの化合物は、I-SceIと直接相互作用しないが、DNA構造、複製、修復機構に影響を与え、DNA切断におけるI-SceIの役割にとって極めて重要である。臭化エチジウム、ドキソルビシン、ダウノルビシン、アクチノマイシンD、クロロキンのようなDNAインターカレート剤はDNAのコンフォメーションを変化させ、I-SceIが特定のDNA部位を認識して切断する能力を阻害する可能性がある。ミトマイシンCやシスプラチンのようなDNAアルキル化剤はDNAと付加体を形成し、I-SceIによるDNA認識と切断を妨害する可能性がある。
カンプトテシンやエトポシドのようなトポイソメラーゼ阻害剤はDNAのトポロジーに影響を与え、I-SceIの活性に影響を与える可能性がある。アフィジコリンはDNAポリメラーゼを阻害することにより、DNA複製に影響を与え、I-SceIが作用するDNAの構造と利用可能性に影響を与える可能性がある。ヒドロキシ尿素とブレオマイシンは、それぞれリボヌクレオチド還元酵素阻害作用とDNA鎖切断作用を通して、I-SceIの機能に間接的に影響を与える可能性のある追加的なメカニズムを示している。
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