Los activadores de la GKAP comprenden una amplia gama de compuestos químicos elegidos específicamente por su capacidad para aumentar indirectamente la actividad funcional de la GKAP en las sinapsis neuronales. La forskolina y el 8-Br-cAMP son activadores que elevan los niveles de AMPc, un segundo mensajero crítico en las neuronas, lo que provoca la activación de la proteína cinasa A (PKA). A continuación, la PKA fosforila diversas proteínas sinápticas, lo que puede potenciar las interacciones y las funciones de andamiaje de la GKAP en la densidad postsináptica. Del mismo modo, la Ionomicina, al aumentar el calcio intracelular, puede facilitar el papel de la GKAP en las vías de señalización sináptica dependientes de los flujos de calcio. Por otro lado, la aplicación de Tetrodotoxina sirve para modular la actividad neuronal mediante el bloqueo de los canales de sodio, lo que podría conducir a una regulación al alza compensatoria de las interacciones proteínicas sinápticas, potenciando así la actividad de GKAP. Tanto la PMA, que activa la PKC, como el ácido okadaico, un inhibidor de las proteínas fosfatasas, conducen a una alteración de los estados de fosforilación de las proteínas en el medio sináptico, lo que podría reforzar las interacciones de andamiaje y las funciones de señalización de GKAP.
Además, compuestos como el BAPTA-AM, la anisomicina, el ácido cainico, el CNQX, el nimodipino y la rianodina contribuyen a afinar el entorno sináptico en el que opera la GKAP. El BAPTA-AM, al quelar el calcio, y el Nimodipino, al bloquear los canales de calcio de tipo L, modulan indirectamente los procesos dependientes del calcio en los que puede estar implicada la GKAP. La anisomicina, aunque inhibe la síntesis proteica, podría modificar el paisaje proteico sináptico de forma que favorezca la actividad de la GKAP. La estimulación excitatoria a través del ácido kaínico o la modulación de la transmisión sináptica a través del CNQX pueden conducir a una mayor función de la GKAP debido a sus efectos sobre el glutamato.
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