DUB3 억제제

일반적인 DUB3 억제제에는 액티노마이신 D CAS 50-76-0, α-아마니틴 CAS 23109-05-9, 독소루비신 CAS 23214-92-8, 5-아자시티딘 CAS 320-67-2, 미트라마이신 A CAS 18378-89-7 등이 포함되지만 이에 국한되지는 않습니다.

DUB3 억제제는 USP17(유비퀴틴 특이적 펩티다제 17) 또는 USP17L2라고도 하는 DUB3로 알려진 탈유비퀴틴화 효소의 활성을 표적으로 하여 억제하도록 특별히 설계된 화합물 종류를 말합니다. 탈유비퀴틴화 효소(DUB)는 유비퀴틴 단백질이 기질 단백질에 부착되어 분해되도록 태그를 붙이거나 세포 내 위치 또는 활성을 변경하는 번역 후 변형인 유비퀴틴화 과정에서 중요한 역할을 합니다. DUB3와 같은 DUB는 기질에서 유비퀴틴 분자를 제거하여 이 과정을 역전시켜 단백질 정체 및 기타 세포 신호 경로를 조절합니다. 따라서 DUB3 억제제는 이 효소의 활성 부위에 결합하여 잠재적으로 촉매 활성에 영향을 미칠 수 있습니다. DUB3를 억제하면 세포 내 유비퀴틴화와 탈유비퀴틴화의 균형에 영향을 미쳐 세포 기능 및 신호 경로에 다양한 하류 영향을 미칠 수 있습니다.

DUB3 억제제 개발은 효소의 구조와 기능을 이해하는 것에서 시작됩니다. X-선 결정학, 핵자기공명(NMR), 극저온 전자 현미경과 같은 구조 생물학 도구를 사용하여 DUB3의 3차원 구조를 결정할 수 있습니다. 이러한 구조 정보를 통해 과학자들은 효소의 탈유비퀴틴화 활동에 중요한 활성 부위와 잠재적 알로스테릭 부위를 식별할 수 있습니다. 그런 다음 고처리량 스크리닝 방법을 사용하여 DUB3의 이러한 부위에 결합 친화성을 보이는 저분자를 검색할 수 있습니다. 이러한 초기 타겟은 DUB3의 효소 활성에 대한 화합물의 억제 효과를 측정하도록 설계된 다양한 시험관 내 분석을 통해 추가로 검증될 수 있습니다. 예를 들어, 형광 또는 전기화학발광을 사용하는 분석법은 기질 단백질에서 유비퀴틴의 방출을 감지하여 억제제의 효능을 나타낼 수 있습니다.