Os inibidores do DnaJC5γ funcionam principalmente através da inibição dos principais processos e vias em que o DnaJC5γ está envolvido. A ciclosporina A e o FK506 são inibidores da calcineurina, uma proteína que desfosforila as sinapsinas. O DnaJC5γ está envolvido na exocitose de vesículas sinápticas, que é mediada por sinapsinas. Por conseguinte, a inibição da calcineurina pode diminuir indiretamente a atividade funcional da DnaJC5γ. Do mesmo modo, o Guanabenz inibe o complexo fosfatase PP1/GADD34 induzido pelo stress, o que pode ter impacto no estado de fosforilação das sinapsinas, levando indiretamente à diminuição da atividade funcional do DnaJC5γ. A leflunomida, um inibidor da diidroorotato desidrogenase, afecta indiretamente a DnaJC5γ através da inibição da síntese de nucleótidos, necessária para a exocitose das vesículas sinápticas.
A bafilomicina A1 e a concanamicina A funcionam inibindo a H+-ATPase de tipo vacuolar (V-ATPase), um componente crucial para a acidificação das vesículas, uma etapa essencial para o carregamento de neurotransmissores e, por conseguinte, para a exocitose das vesículas sinápticas. A inibição deste processo pode diminuir indiretamente a atividade funcional do DnaJC5γ. O salubrinal, um inibidor da desfosforilação do eIF2α, pode afetar a síntese proteica, o que tem um impacto indireto na atividade funcional do DnaJC5γ, uma vez que está envolvido na exocitose das vesículas sinápticas. A tunicamicina inibe a glicosilação ligada à N, uma modificação pós-traducional que pode afetar indiretamente a atividade funcional do DnaJC5γ, que ajuda na dobragem e maturação das proteínas. Os inibidores do proteassoma, como o MG132 e o bortezomib, podem afetar indiretamente a funcionalidade do DnaJC5γ, que pode estar envolvido nas vias de degradação das proteínas. Finalmente, a 2-desoxiglicose e o 3-bromopiruvato, inibidores da glicólise, podem afetar indiretamente a atividade funcional do DnaJC5γ, que faz parte da homeostase proteica que requer energia.
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