Chondroitinase阻害剤

一般的なコンドロイチナーゼ阻害剤には、硫酸銅（II）CAS 7758-98-7、亜鉛 CAS 7440-66-6、硝酸銀 CAS 7761-88-8、フェニルメチルスルホニルフルオリド CAS 329-98-6、1,10-フェナントロリン CAS 66-71-7。

コンドロイチナーゼの化学的阻害剤は、その活性部位や必須補酵素との相互作用が関与することが多く、様々なメカニズムでその酵素活性を阻害する。硫酸銅(II)はその活性部位と相互作用することによってコンドロイチナーゼを不活性化し、酵素の三次構造あるいは四次構造を変化させる可能性がある。塩化亜鉛はコンドロイチナーゼの活性に不可欠な金属イオンと競合し、その機能を低下させる。硝酸銀はシステイン残基のチオール基に結合してコンドロイチナーゼをさらに阻害するが、これは酵素の活性コンフォメーションと機能の維持に不可欠である。エチレンジアミン四酢酸（EDTA）もキレート剤で、必要な金属イオンをコンドロイチナーゼから遠ざけ、酵素活性を失わせる。

さらに、コンドロイチナーゼの活性部位のセリン残基は、フェニルメチルスルホニルフルオリド（PMSF）によって不可逆的に修飾され、その機能を直接阻害する。1,10-フェナントロリンは、必須金属イオンをキレート化することで作用し、コンドロイチナーゼの作用に必要な補酵素を奪う。N-エチルマレイミド（NEM）とヨードアセトアミドは、チオール基のアルキル化によって、触媒作用に重要な酵素内のシステイン残基を修飾し、コンドロイチナーゼを不活性化する。ペプスタチンAやロイペプチンのような阻害剤は、コンドロイチナーゼの翻訳後プロセシングや活性化に関与する可能性のあるプロテアーゼを標的とするため、間接的に酵素の機能を阻害する。最後に、E-64は、コンドロイチナーゼの成熟や分解に関与する可能性のあるシステインプロテアーゼに不可逆的に結合し、その結合によって酵素が不活性な状態を保つことを保証する。