CCDC130阻害剤には、CCDC130が関与する様々な細胞経路やプロセスを標的とする様々な化合物が含まれる。例えば、ラパマイシンなどのmTOR阻害剤は、繊毛形成やオートファジーの制御因子として知られるmTORC1活性をダウンレギュレートすることにより、CCDC130を阻害する。CCDC130はこれらのプロセスに関与しているため、mTOR阻害はCCDC130の機能的活性の低下をもたらす可能性がある。同様に、LY294002のようなPI3K/Akt経路の阻害剤は、繊毛形成におけるCCDC130の役割に不可欠なプロセスを阻害することにより、CCDC130の活性に下流から影響を及ぼす可能性がある。このように、上流の制御因子を標的とすることは、間接的ではあるが、CCDC130の機能を調節する効果的な戦略となりうる。
ペルヘキシリンや2-デオキシ-D-グルコースなどの他の化合物は、細胞の代謝やエネルギー状態に影響を与える。これらの代謝経路を変化させることにより、これらの阻害剤は、代謝ストレスに直面した細胞が繊毛形成のような特殊なプロセスよりも生存を優先させるため、CCDC130活性の低下につながる可能性がある。
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