Inhibiteurs BAP1

Les inhibiteurs courants de la BAP1 comprennent, entre autres, le cisplatine CAS 15663-27-1, le peroxyde d'hydrogène CAS 7722-84-1, la doxorubicine CAS 23214-92-8, l'étoposide (VP-16) CAS 33419-42-0 et le fluorouracile CAS 51-21-8.

Les inhibiteurs de BAP1 sont une catégorie d'agents chimiques qui ciblent l'enzyme BAP1 (protéine 1 associée à BRCA1), une enzyme déubiquitinante qui joue un rôle crucial dans le remodelage de la chromatine, la réponse aux dommages de l'ADN et la régulation du cycle cellulaire. BAP1 est un membre de la famille des hydrolases carboxy-terminales de l'ubiquitine (UCH) et est impliqué dans le retrait de l'ubiquitine de substrats protéiques spécifiques, modifiant ainsi leur stabilité, leur localisation et leur fonction. L'activité de BAP1 module divers processus cellulaires en régulant le statut d'ubiquitination des histones et d'autres protéines régulatrices clés. Les inhibiteurs de BAP1 sont donc de petites molécules ou d'autres entités chimiques qui se lient spécifiquement au site actif ou aux sites allostériques de l'enzyme, entravant son activité déubiquitinante. Ce faisant, ces inhibiteurs peuvent affecter les voies dépendantes de l'ubiquitine dans lesquelles BAP1 joue un rôle crucial, influençant le paysage des modifications post-traductionnelles de la cellule.

La structure chimique des inhibiteurs de BAP1 est diverse, reflétant souvent la complexité de la spécificité des substrats de l'enzyme et les mécanismes nuancés par lesquels elle reconnaît et traite les motifs ubiquitine. Ces inhibiteurs possèdent généralement un motif qui imite l'état de transition ou le substrat de BAP1, leur permettant de se lier avec une grande affinité au site actif de l'enzyme. Cette imitation est essentielle pour la spécificité et l'efficacité de l'inhibiteur dans l'obstruction de l'activité enzymatique de BAP1. La conception de telles molécules prend en compte la conformation tridimensionnelle du cœur catalytique de BAP1, ainsi que la position des résidus d'acides aminés clés qui participent à la reconnaissance et à l'hydrolyse de l'ubiquitine. Les inhibiteurs peuvent également comporter divers groupes fonctionnels qui renforcent leur liaison par des interactions covalentes ou non covalentes, telles que les liaisons hydrogène, les interactions hydrophobes ou les forces de van der Waals.