아타제의 화학적 억제제는 퓨린 합성 경로를 표적으로 하여 기능 억제를 달성합니다. 디하이드로폴레이트 환원효소 억제제인 메토트렉세이트는 아타제의 효소 기능에 필수적인 기질인 퓨린 뉴클레오타이드의 생성을 제한하여 아타제를 간접적으로 억제합니다. 이노신 모노포스페이트 탈수소효소 억제제인 마이코페놀산과 리바비린은 구아노신 뉴클레오타이드 풀을 더욱 감소시켜 아타제의 기질 가용성을 제한합니다. 6-메르캅토퓨린 및 6-티오구아닌과 같은 퓨린 유사체는 아타제의 활성 부위에 대한 천연 기질과 경쟁하여 효소가 뉴클레오티드 생합성에서 역할을 수행하지 못하도록 방해합니다. 6-메르캅토퓨린으로 대사되는 아자티오프린은 퓨린 기질과 경쟁하여 아타제를 방해하는 유사한 전략을 사용합니다.
뉴클레오타이드 유사체인 클로파라빈과 플루다라빈은 뉴클레오타이드 대사의 효소를 억제하여 기질 부족으로 인한 아타제의 기능을 간접적으로 제한하는 뉴클레오타이드 풀을 감소시키는 것으로 알려져 있습니다. 또 다른 퓨린 유사체인 클라드리빈은 핵산 대사를 방해하여 뉴클레오타이드 풀을 감소시켜 아타제의 작용을 간접적으로 제한합니다. 티아조푸린은 이노신 일인산 탈수소효소를 억제하여 퓨린 합성을 감소시키고, 이는 다시 아타제 활성에 필요한 기질을 제한합니다. 주로 항바이러스 특성으로 알려진 아시클로버는 구아닌 뉴클레오티드와 경쟁하는 구아닌 유사체로, 아시클로버가 포함되면 아타제에 필요한 기질 풀이 의도치 않게 감소할 수 있습니다. 아데노신 유사체인 디다노신은 인산화되어 DNA에 통합되면 DNA 합성을 방해하여 간접적으로 아타제에 의해 합성되는 뉴클레오타이드의 수요를 감소시켜 세포 내에서 효소의 기능을 방해할 수 있습니다.
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