PGC-1α阻害剤には、PGC-1αの活性を間接的に調節できる様々な化合物が含まれる。この調節は、PGC-1αと相互作用する他のタンパク質やシグナル伝達経路への影響によって起こる。例えば、AICARやメトホルミンのようなAMPK活性化剤は、PGC-1αをリン酸化し、その転写コアクチベーター機能に影響を与える。GW501516、フェノフィブラート、ピオグリタゾン、ロシグリタゾンのようなPPARアゴニストは、PGC-1αの発現レベルと活性を変化させ、それによってPGC-1αが関与する代謝経路に間接的に影響を与える。
さらに、レスベラトロールのようなSIRT1活性化剤やEX-527のような阻害剤は、PGC-1αの活性や他の転写因子との相互作用に重要なアセチル化状態に影響を与える可能性がある。この翻訳後修飾は、ミトコンドリアの生合成と酸化代謝におけるPGC-1αの役割を規定する。PGC-1αはミトコンドリア機能、糖新生、脂肪酸酸化に関与する遺伝子の発現を制御し、エネルギー代謝の中心的な調節ハブであることから、これらの化学物質によるPGC-1α活性の調節は重要である。
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