Sox-4 Double Nickase Plasmid (h): sc-401217-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das Sox-4 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- Sox-4 Double-Nickase-Plasmid (h) und Sox-4 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf SOX4 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: Sox-4: sc-518016
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
Sox-4 Double Nickase Plasmid (h) | sc-401217-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
Sox-4 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-401217-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
SOX4 kodiert den Transkriptionsfaktor Sox-4, ein Mitglied der SRY-verwandten HMG-Box-Familie, das an DNA bindet, um die Festlegung von Zelllinien (Lineage Specification), die Differenzierung und Entscheidungen über das Zellschicksal zu regulieren. In menschlichen Zellen verknüpft Sox-4 Entwicklungsprogramme mit Signalwegen wie Wnt/β-Catenin, TGF-β/SMAD und Notch und beeinflusst dabei transkriptionelle Netzwerke, die Proliferation und die epithelial–mesenchymale Transition steuern. Eine fehlregulierte SOX4-Expression wurde bei mehreren Tumorarten mit veränderten Differenzierungszuständen und onkogenen Transkriptionsprogrammen in Verbindung gebracht sowie mit neuroentwicklungsbezogenen und immunassoziierten Phänotypen. Diese Eigenschaften machen SOX4 zu einem nützlichen Knotenpunkt, um kontextabhängige transkriptionelle Kontrolle, Chromatin-Zustandsübergänge und das Zusammenspiel von Signalwegen in krankheitsrelevanten Modellen zu untersuchen.
Sox-4 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des SOX4-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von SOX4 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die SOX4-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit SOX4-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.