Sox-21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406354

Übersicht

SOX21 kodiert den Transkriptionsfaktor Sox-21, ein DNA-bindendes Protein mit HMG-Box (High-Mobility-Group), das die Festlegung von Zelllinien sowie Differenzierungsprogramme in ektodermalen und neuralen Geweben reguliert. Sox-21 ist Teil transkriptioneller Netzwerke, die mit der Notch- und Wnt-Signalgebung verknüpft sind, und kann – kontextabhängig durch Genrepression oder -aktivierung – das Gleichgewicht zwischen der Aufrechterhaltung von Vorläuferzellen und der neuronalen Reifung beeinflussen. Während der Entwicklung trägt es zur Festlegung von Zellschicksalen und zur Gewebemusterbildung bei und ist damit ein geeigneter Knotenpunkt für die Untersuchung der transkriptionellen Kontrolle von Neurogenese und epidermaler Differenzierung. Eine fehlregulierte SOX21-Expression wurde in mehreren Tumortypen sowie in aberranten Differenzierungszuständen beschrieben, was die Erforschung seiner Rollen in onkogenen Transkriptionsprogrammen und Zellzustandsübergängen unterstützt.

Das Sox-21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SOX21-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SOX21-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SOX21 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Sox-21-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SOX21-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Sox-21-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SOX21-Exone abzielen, die für die Sox-21-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SOX21-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Sox-21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Sox-21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SOX21-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Sox-21 HDR-Plasmid (h) und Sox-21 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SOX21-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SOX21-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.