CDK11 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-405330

Panoramica

CDK19 codifica una chinasi ciclina-dipendente che opera all’interno del modulo chinasi del complesso Mediator per modulare la trascrizione dipendente dalla RNA polimerasi II e la fosforilazione di substrati associati alla trascrizione. Attraverso la regolazione dei programmi di inizio e di elongazione della trascrizione, CDK19 influenza la progressione del ciclo cellulare, l’espressione genica responsiva allo stress e reti trascrizionali dipendenti dal segnale collegate alla via MAPK e ad altre vie. Un’attività o un’espressione deregolata di CDK19 è stata associata ad alterazioni del controllo proliferativo e a un rimodellamento trascrizionale osservati in molteplici contesti tumorali e in altri disordini proliferativi. CDK11 è una chinasi serina/treonina multifunzionale coinvolta nella regolazione del ciclo cellulare, nello splicing del pre-mRNA e nel controllo della trascrizione, a supporto di studi sul crosstalk tra reti di chinasi e sulla segnalazione compensatoria nelle cellule umane.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO CDK11 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene CDK19 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del CDK19 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto CDK19 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina CDK11.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di CDK19 per lo studio della segnalazione di CDK11, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni CDK19 critici per la funzione di CDK11
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di CDK19 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal CDK11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal CDK11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus CDK19. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal CDK11 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR CDK11 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia CDK19 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio CDK19 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.