DNA pol ε cat 抑制因子

常见的 DNA pol ε cat 抑制剂包括（但不限于）雷公藤内酯 CAS 38748-32-2、5-氮杂胞嘧啶 CAS 320-67-2、雷帕霉素 CAS 53123-88-9、氟尿嘧啶 CAS 51-21-8 和三环锡 A CAS 58880-19-6。

DNA聚合酶ε催化（pol ε cat）抑制剂是一类专门设计用于靶向和抑制DNA聚合酶ε酶催化活性的化合物，该酶是复制过程中参与引物链DNA合成的关键酶。DNA聚合酶ε在DNA复制过程中保持高保真度方面发挥着关键作用，有助于基因组的精确复制。DNA聚合酶ε的催化结构域包含负责新DNA链合成过程中核苷酸添加的活性位点。DNA pol ε cat的抑制剂通过与该催化区域结合来阻止核苷酸进入不断增长的DNA链。这些抑制剂可以通过不同的机制发挥作用，包括竞争性抑制（直接与天然核苷酸底物竞争）和非竞争性机制（在活性位点以外的其他位点结合，从而引起结构变化，降低催化效率）。设计DNA聚合酶ε催化抑制剂的目标是使酶的催化亚基具有高度特异性，确保对参与DNA合成的其他相关聚合酶的脱靶效应降至最低。DNA聚合酶ε催化抑制剂的开发需要对酶的结构及其催化功能所需的分子相互作用有深入的了解。结构生物学技术，如X射线晶体学和冷冻电子显微镜（cryo-EM），用于阐明DNA pol ε的三维结构，从而深入了解其活性位点结构和重要催化残基的排列。这些结构信息使研究人员能够识别适合抑制剂结合的关键结合口袋和区域。然后，研究人员采用分子对接和分子动力学模拟等计算方法来模拟潜在抑制剂与DNA聚合酶ε催化位点之间的相互作用，从而优化其结合亲和力和选择性。结构-活性关系（SAR）分析用于修改抑制剂的化学结构，以增强其与催化域的结合能力，重点改善溶解性、稳定性和选择性等性质。DNA聚合酶ε抑制剂可能包括能够精确嵌入酶活性位点的小有机分子，旨在与催化残基或结合口袋内的疏水接触形成特定的相互作用，例如氢键。这些抑制剂的成功开发需要化学合成、结构分析以及计算建模的迭代方法，旨在有效抑制DNA聚合酶ε的催化活性，并更好地了解其在DNA复制中的作用。