含有转录延伸因子 A(SII)N-端和中心结构域的化学抑制剂可通过各种机制影响转录过程。DRB 通过阻断 RNA 聚合酶 II C 端结构域(CTD)的磷酸化来靶向这种蛋白质,这是转录延伸阶段的关键步骤。同样,黄酮哌啶醇通过抑制 CTD 磷酸化所必需的细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs)在上游发挥作用,而 CTD 磷酸化对转录延伸因子 A(SII)的功能至关重要。在更直接的层面上,α-Amanitin 与 RNA 聚合酶 II 结合,阻碍其沿着 DNA 移动,从而抑制了延伸过程。雷公藤内酯通过共价修饰 RNA 聚合酶 II 的亚基来发挥抑制作用,从而有效地关闭转录机制。
在转录途径的更远处,放线菌素 D 会插入 DNA,阻碍 RNA 聚合酶 II 继续前进,从而停止延伸过程。虫草素通过将自身结合到 RNA 链中,导致 mRNA 合成过早终止,从而抑制了转录延伸因子 A(SII)的作用。ICRF-187可螯合核糖核苷酸还原酶的重要辅助因子铁,从而间接影响转录。喜树碱和依托泊苷等拓扑异构酶抑制剂能阻止 DNA 上卷的松弛,而这种松弛是转录延伸所必需的,因此间接影响了转录延伸因子 A(SII)的功能。其他化合物,如 Rocaglamide、Betulinic Acid 和 Silvestrol 会破坏转录和翻译机制的不同方面,通过影响转录的启动和延伸阶段或诱导 RNA 聚合酶 II 的降解,间接抑制转录延伸因子 A (SII) 的功能。
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