Set1B Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h): sc-406129

Visão geral

SETD1B codifica a metiltransferase de lisina Set1B, um componente catalítico de complexos modificadores de cromatina do tipo COMPASS que depositam marcas de metilação em H3K4 associadas à cromatina transcricionalmente ativa. Por meio da regulação de estados de promotores e potenciadores (enhancers), a Set1B contribui para programas de expressão gênica dependentes da RNA polimerase II que influenciam a identidade celular, a proliferação e a diferenciação. A atividade de SETD1B se cruza com vias epigenéticas mais amplas que governam a acessibilidade da cromatina e as respostas a dano no DNA, ao moldar paisagens de modificações de histonas. Variações genéticas e a desregulação de SETD1B têm sido associadas a fenótipos do neurodesenvolvimento e a alterações no controle transcricional, tornando-o um alvo relevante para estudos mecanísticos de regulação gênica em células humanas.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO Set1B (h) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene SETD1B em linhas celulares human. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do SETD1B, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do SETD1B na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína Set1B.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de SETD1B para a investigação da sinalização de Set1B, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) SETD1B críticos para a função Set1B
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos SETD1B para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo Set1B Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h) e pelo Set1B Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h2) têm como alvo locais distintos dentro do locus SETD1B. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo Set1B Plasmídeo HDR (h) e o Plasmídeo HDR Set1B (h2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia SETD1B para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo SETD1B definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.