SDAD (NHS-SS-Diazirine)

SDAD, abreviatura de NHS-SS-Diazirina, é um composto amplamente utilizado no estudo de interacções moleculares em sistemas biológicos, particularmente através do método de marcação por fotoafinidade. Este produto químico integra um éster de N-hidroxissuccinimida (NHS), uma ponte dissulfureto (SS) e um grupo diazirina, cada um contribuindo com capacidades funcionais cruciais que facilitam a investigação bioquímica aprofundada. A porção éster NHS do SDAD é fundamental para a sua capacidade de formar ligações amida estáveis com grupos amina primários, normalmente encontrados nas cadeias laterais dos resíduos de lisina ou nos terminais N das proteínas. Isto facilita a ligação covalente da molécula SDAD às proteínas alvo de uma forma específica e eficiente. A inclusão do éster NHS aumenta significativamente a reatividade do composto em relação a estes nucleófilos biológicos, permitindo modificações precisas das proteínas em condições suaves. No centro da utilidade do SDAD está o grupo diazirina, uma porção fotoactivável conhecida pela sua capacidade de gerar espécies de carbeno altamente reactivas após irradiação com luz UV. Este intermediário reativo pode formar ligações covalentes com uma variedade de estruturas moleculares próximas, capturando interacções e conformações dinâmicas de proteínas no seu estado nativo. Além disso, a ponte dissulfureto no SDAD introduz uma ligação reversível, que pode ser clivada em condições redutoras. Esta caraterística é especialmente útil em metodologias de investigação em que a libertação e recuperação subsequentes de péptidos reticulados são necessárias para fins analíticos, como a espetrometria de massa.