PCDH17 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-405740

Descripción general

PCDH17 (protocadherina-17) es una molécula de adhesión célula–célula dependiente de calcio de la familia de las protocadherinas, implicada en el establecimiento y mantenimiento de la arquitectura tisular, especialmente en el sistema nervioso. Al mediar interacciones homofílicas en la membrana plasmática, PCDH17 contribuye al crecimiento de neuritas, la conectividad sináptica y los procesos de clasificación celular que dan forma a la formación de circuitos. La dinámica de adhesión asociada a PCDH17 se cruza con la remodelación del citoesqueleto y con vías de señalización que regulan la migración y la diferenciación, incluidos procesos vinculados a las GTPasas de la familia Rho. Se ha informado de una expresión desregulada o del silenciamiento epigenético de PCDH17 en múltiples contextos tumorales, y se estudia su papel en la adhesión alterada, el comportamiento invasivo y programas transcripcionales específicos de linaje.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO PCDH17 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen PCDH17 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del PCDH17 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de PCDH17 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína PCDH17.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en PCDH17 para la investigación de la señalización de PCDH17, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de PCDH17 críticos para la función de PCDH17
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de PCDH17 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido PCDH17 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido PCDH17 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus PCDH17. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR PCDH17 (h) y el plásmido HDR PCDH17 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología PCDH17 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana PCDH17 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.