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Fibulin-3 CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-432105-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
Fibulin-3 CRISPR Activationプラスミド (m2) | sc-432105-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
Efemp1は、細胞外マトリックス(ECM)糖タンパク質であるフィブリン-3(fibulin-3)をコードしており、弾性線維に関連するミクロフィブリルに組み込まれて、マトリックスの組み立てと安定性を調節します。マウス組織では、フィブリン-3は細胞外マトリックスの構造化とプロテアーゼ活性を形作ることで、細胞―マトリックス接着、遊走、組織リモデリングに影響し、その下流で線維化、血管新生、炎症シグナルに関連する経路に作用します。フィブリン-3の量的変化は結合組織や網膜の表現型と関連づけられており、腫瘍微小環境のリモデリングや加齢に伴う変性過程など、マトリックス制御異常の文脈でしばしば研究されています。そのためEfemp1は、細胞外マトリックス組成がメカノバイオロジーやストレス応答プログラムをどのように制御するかを探るうえで、扱いやすい標的遺伝子座となります。
Fibulin-3 CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Efemp1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Fibulin-3 CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Efemp1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はEfemp1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Fibulin-3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のEfemp1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるFibulin-3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびEfemp1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるFibulin-3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。