ESET Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-401325
- Especies Diana: human
- 20 µg de plásmido de ADN purificado listo para la trasfección; suficiente para 20 transfecciones máximo
- ESET El plásmido CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales codifica la nucleasa Cas9 y un ARN guía (gRNA) de 20 nt específico para el objetivo, diseñado para lograr la máxima eficiencia de knockout utilizando secuencias derivadas de la biblioteca GeCKO v2
- Las secuencias de gRNA dirigen a Cas9 para que induzca roturas de doble cadena (DSB) específicas en el locus genómico ESET, lo que da lugar a la inactivación del gen mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ)
- Se recomienda el plásmido HDR ESET (h) (sc-401325-HDR) para la cotransfección con el plásmido CRISPR/Cas9 KO ESET (h) a fin de permitir la selección de células editadas con éxito mediante la integración mediada por HDR de un casete de resistencia a la puromicina y un gen reportero RFP
- El plásmido HDR ESET (h) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales contiene una plantilla de reparación dirigida por homología (HDR) correspondiente a los sitios diana del ARN guía (gRNA) en el plásmido CRISPR/Cas9 KO ESET (h)
- Cada plásmido HDR contiene dos brazos de homología de ~800 pb que flanquean los casetes de resistencia a la puromicina y RFP, diseñados para unirse a secuencias de ADN genómico que rodean el sitio de rotura de doble cadena inducida por Cas9 y facilitar la integración precisa mediada por HDR
- Los genes de resistencia a la puromicina y RFP están flanqueados por sitios LoxP, lo que permite la eliminación de los marcadores de selección mediante la recombinasa Cre (Vector Cre: sc-418923) tras el establecimiento de líneas celulares knockout estables
- Tras la transfección, la eficacia del knockout puede comprobarse mediante WB, IF ó IHC utilzando el anticuerpo: ESET Anticuerpo (A-1): sc-166621
Información sobre pedidos
| Nombre del producto | Número de catálogo | UNIDAD | Precio | CANTIDAD | Favoritos | |
ESET Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h) | sc-401325 | 20 µg | $397.00 | |||
ESET Plásmido HDR (h) | sc-401325-HDR | 20 µg | $445.00 |
Descripción general
La SETDB1 (ESET) humana es una metiltransferasa de histonas que contiene un dominio SET y cataliza la trimetilación de H3K9, estableciendo cromatina represiva y promoviendo la formación de heterocromatina. Mediante interacciones con KAP1/TRIM28, proteínas KRAB con dedos de zinc y otros reguladores de la cromatina, SETDB1 contribuye al silenciamiento de elementos transponibles y modula programas de transcripción durante el desarrollo y el mantenimiento del destino celular. Su actividad se integra en vías de control epigenético que gobiernan la estabilidad del genoma, las respuestas al daño en el ADN y la organización de la cromatina a larga distancia. La desregulación de la expresión o la función de SETDB1 se ha vinculado con una represión transcripcional alterada y estados aberrantes de la cromatina observados en múltiples contextos asociados a enfermedad, incluidos programas oncogénicos y fenotipos relacionados con el neurodesarrollo.
El plásmido CRISPR/Cas9 KO ESET (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción selectiva del gen SETDB1 en líneas celulares human. Cada plásmido del conjunto coexpresa un ARN guía específico (sgRNA) único, dirigido a un sitio distinto dentro del locus SETDB1, junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes, y codifica GFP para permitir la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito. Esta estrategia multiguía aumenta la probabilidad de inducir desplazamientos de marco de lectura o deleciones que produzcan una inactivación funcional, ofreciendo una alternativa más robusta a los enfoques de guía única. Las DSB inducidas en múltiples sitios se resuelven mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ) o, cuando se utiliza con la plantilla donante HDR incluida, mediante reparación dirigida por homología (HDR) en un sitio diana definido dentro del locus.
Cuando se utiliza junto con el donante HDR que expresa RFP, la fluorescencia de GFP y RFP puede utilizarse conjuntamente para distinguir las poblaciones de células transfectadas de las editadas, lo que agiliza los flujos de trabajo de clasificación y selección de clones basados en citometría de flujo.
Donante de reparación dirigida por homología (HDR) — Casete de puromicina con reportero RFP
Para aplicaciones que requieren clones knockout confirmados y seleccionables, el plásmido HDR ESET (h) incluye un constructo donante HDR que contiene un casete de resistencia a la puromicina (PuroR) y un reportero de proteína fluorescente roja (RFP), flanqueado por brazos de homología específicos de un sitio diana definido SETDB1.
Cuando se cotransfecciona con el plásmido ESET CRISPR/Cas9 KO (h):
- El casete PuroR-RFP se integra en el sitio de corte de Cas9 mediante HDR, interrumpiendo el marco de lectura abierto SETDB1.
La fluorescencia de la RFP proporciona un indicador visual inmediato del éxito de la integración, lo que permite la identificación o clasificación basada en la fluorescencia de las células editadas antes o junto con la selección con puromicina.
Las células editadas con éxito se confirman mediante la resistencia a la puromicina, lo que reduce sustancialmente la carga de cribado de clones.
Esta estrategia de selección es ideal para generar líneas celulares KO clonales estables para estudios funcionales posteriores, cribado de fármacos o desarrollo de modelos.
Sistema de eliminación del casete Cre-lox
La construcción donante HDR cuenta con sitios loxP que flanquean el casete de selección PuroR-RFP para permitir la eliminación limpia del marcador tras la confirmación del clon. La expresión transitoria de la recombinasa Cre a través del vector Cre: sc-418923 incluido extirpa el casete, dejando un sitio loxP residual mínimo dentro del locus SETDB1 y eliminando posibles efectos de confusión en los ensayos posteriores.
Este enfoque en dos pasos:
- Minimiza la alteración de la arquitectura local de la cromatina y de los elementos reguladores vecinos
Restaura un contexto genómico casi nativo en el locus editado
Permite reutilizar la estrategia de selección con puromicina en la misma línea celular para ediciones adicionales
Características principales
- gRNA dirigido a los exones SETDB1 críticos para la función ESET
Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para una administración simplificada
Donante HDR con resistencia a la puromicina para la selección positiva de clones
Casete PuroR flanqueado por loxP con vector de recombinasa Cre para la eliminación sin fisuras del marcador
Se suministra listo para su uso mediante transfección
Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.