Os inibidores químicos do ZNF548 podem impedir a sua função através de várias vias moleculares. A queleritrina, por exemplo, é um inibidor robusto da proteína quinase C (PKC), que é essencial para a fosforilação de muitas proteínas, incluindo factores de transcrição. Ao inibir a PKC, a queleritrina pode impedir a fosforilação do ZNF548, levando à sua inibição funcional. Do mesmo modo, o LY333531 actua seletivamente para inibir a PKCβ, que está potencialmente envolvida na fosforilação do ZNF548. Por conseguinte, a ação específica do LY333531 pode impedir a ativação ou a modulação do ZNF548 através da fosforilação. O GW5074 tem como alvo a quinase Raf-1 no âmbito da via MAPK/ERK, que é conhecida por regular a atividade dos factores de transcrição. Ao inibir a Raf-1, o GW5074 pode impedir a ativação do ZNF548 que normalmente ocorreria através desta via.
Além disso, o PD173955 bloqueia as cinases da família Src, que estão implicadas na fosforilação e subsequente regulação dos factores de transcrição, afectando assim a capacidade do ZNF548 para se ligar ao ADN ou interagir com outras moléculas. O ibrutinib inibe a tirosina quinase de Bruton, que faz parte das vias de sinalização que regulam o ZNF548, e a sua inibição pode perturbar essas vias. O SL327 e o PD98059 inibem a MEK, outra quinase da via MAPK/ERK. A sua ação pode impedir a fosforilação reguladora do ZNF548, inibindo assim a sua atividade. O SP600125 inibe a via JNK, que também desempenha um papel na fosforilação reguladora de factores de transcrição como o ZNF548. O SB431542 inibe a quinase ALK5 do recetor de TGF-β de tipo I, envolvida nas vias de sinalização do TGF-β que podem controlar a função do ZNF548. A inibição do NF-κB pela triptolida pode levar à inibição a jusante do ZNF548, uma vez que este pode ser regulado pela sinalização dependente do NF-κB. Por último, a rapamicina, um inibidor da mTOR que regula a atividade proteica, pode levar à inibição funcional do ZNF548 se este for regulado pela via da mTOR.
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