Os inibidores químicos da proteína transportadora de zinco ZIP3 podem interferir com a sua função através de vários mecanismos, principalmente visando resíduos de cisteína e locais de ligação ao zinco que são essenciais para a atividade da proteína. A MTSEA, por exemplo, modifica seletivamente os resíduos de cisteína acessíveis, que são cruciais para a integridade estrutural da ZIP3. Ao alquilar estes resíduos, a MTSEA pode inibir a ZIP3, perturbando a sua integridade estrutural ou interferindo com o seu mecanismo de transporte de iões. Do mesmo modo, a iodoacetamida e a N-etilmaleimida também alquilam os resíduos de cisteína, levando potencialmente à inibição da atividade do ZIP3 através de perturbações conformacionais. O óxido de fenilarsina, ao ligar-se a ditióis vicinais na estrutura da proteína, pode inibir a função de proteínas ricas em cisteína, como o ZIP3, se forem necessários grupos ditióis intactos para a sua função.
Outros inibidores afectam a função da ZIP3 alterando a disponibilidade de zinco ou imitando a sua ligação. O cloreto de cádmio, por exemplo, pode substituir os iões de zinco nas proteínas, inibindo enzimas que necessitam de zinco, como a ZIP3, através de inibição competitiva. O TPEN, um quelante de zinco de alta afinidade, esgota o substrato necessário para a atividade da ZIP3, inibindo assim a sua função. O DTNB, ao reagir com grupos tiol livres, pode modificar grupos tiol essenciais e interromper a atividade da ZIP3. O piritionato de zinco perturba a homeostasia do zinco, o que pode inibir indiretamente a atividade de transporte de zinco do ZIP3. O Ziram, um pesticida ditiocarbamato, quelata iões de zinco, reduzindo potencialmente a disponibilidade de zinco para o transporte da ZIP3. O ácido dipicolínico, ao quelar o zinco, priva a ZIP3 do seu ião metálico essencial, conduzindo a uma inibição funcional. A quercetina pode inibir os transportadores de iões metálicos ligando-se a sítios de ligação a metais, o que sugere que pode alterar o sítio crítico de ligação a metais do ZIP3. Por último, o Ebselen, com as suas propriedades modificadoras do tiol, pode modificar grupos tiol específicos essenciais para a atividade do ZIP3 e inibir a sua função.
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