O ZBTB44 utiliza vários mecanismos para modular o estado de fosforilação e a atividade desta proteína. A forskolina, ao ativar a adenilil ciclase, aumenta a concentração intracelular de AMP cíclico, que, por sua vez, ativa a proteína quinase A (PKA). A PKA, uma quinase essencial em numerosos processos celulares, pode fosforilar o ZBTB44, alterando a sua função. Do mesmo modo, o dibutiril AMPc, um análogo do AMPc permeável à membrana, ativa a PKA e pode também levar à fosforilação do ZBTB44. Numa via relacionada, o PMA ativa a proteína quinase C (PKC), outra quinase com amplas funções celulares, que pode então ter como alvo o ZBTB44 para fosforilação. A tapsigargina e a ionomicina elevam os níveis de cálcio intracelular, mas através de mecanismos diferentes. A tapsigargina inibe a bomba SERCA, levando a um aumento dos níveis de cálcio citosólico, enquanto a ionomicina actua como um ionóforo de cálcio, aumentando diretamente o cálcio intracelular, o que pode ativar uma série de proteínas quinases dependentes do cálcio capazes de fosforilar o ZBTB44.
Outros produtos químicos actuam inibindo as fosfatases, o que, por sua vez, leva a um aumento dos níveis de fosforilação das proteínas celulares, incluindo o ZBTB44. A calicilina A e o ácido ocadaico são inibidores potentes das serina/treonina fosfatases PP1 e PP2A, resultando na manutenção do estado de fosforilação das suas proteínas de substrato. A cantharidina também inibe estas fosfatases, promovendo um resultado semelhante. Outra camada de regulação é fornecida pela anisomicina, que induz proteínas quinases activadas pelo stress e, embora seja principalmente conhecida como um inibidor da síntese proteica, pode indiretamente levar à fosforilação do ZBTB44. O piceatanol e a estauroporina, embora sejam tipicamente inibidores de cinases, podem levar a respostas celulares compensatórias que activam vias alternativas que resultam na fosforilação do ZBTB44. A esturosporina, especialmente a baixas concentrações, pode ativar não seletivamente cinases que podem ter como alvo o ZBTB44. Por último, o FTY720, depois de ser fosforilado in vivo, modula os receptores de esfingosina-1-fosfato, que podem ter efeitos a jusante que incluem a ativação do ZBTB44.
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