Os inibidores do WDR65 englobam uma série de compostos químicos que limitam a atividade funcional do WDR65 através da sua influência em várias vias de sinalização e processos celulares. A esturosporina, um inibidor de cinase de largo espetro, interrompe de forma não específica a sinalização mediada por cinase, o que poderia diminuir os requisitos funcionais do WDR65 nestas vias. Do mesmo modo, os inibidores da PI3K LY 294002 e Wortmannin, juntamente com o inibidor duplo da PI3K/mTOR GSK2126458, podem reduzir a atividade do WDR65 diminuindo a sinalização PI3K/AKT, uma via que pode ser crítica para o papel do WDR65 na célula. Os inibidores específicos da MEK PD 98059, U0126 e Cobimetinib, que reduzem a ativação da ERK na via da MAPK, podem também levar à redução da atividade do WDR65 se este estiver implicado em processos mediados pela ERK. A triciribina, que tem como alvo a AKT, e a rapamicina, um inibidor da mTOR, contribuem ainda mais para a potencial desregulação da função do WDR65 através das suas respectivas acções inibitórias.
Além disso, a inibição do proteassoma pelo bortezomib pode levar a uma perturbação geral da homeostase celular, afectando indiretamente a capacidade funcional do WDR65. A via da JNK, visada pelo SP600125, e da p38 MAPK, visada pelo SB 203580, estão ambas associadas a respostas ao stress celular; a sua inibição poderia reduzir a atividade do WDR65 se este estivesse envolvido nestas vias de sinalização relacionadas com o stress. Inibidores como estes, ao reduzirem a atividade de moléculas e vias de sinalização com as quais o WDR65 pode estar funcionalmente integrado, oferecem uma abordagem multifacetada para inibir indiretamente a atividade da proteína através da perturbação dos seus potenciais intermediários e moduladores de sinalização.
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