Os activadores da USP36 são uma classe de compostos que aumentam a atividade funcional da USP36 através de interacções directas ou indirectas. Por exemplo, a forskolina, o IBMX, o BAY 60-6583, a anandamida, o Dibutiril AMPc e a Prostaglandina E2 actuam através da via AMPc-PKA. Aumentam os níveis intracelulares de AMPc, o que leva à ativação da PKA. A PKA fosforila então as proteínas nas vias relacionadas com o USP36, aumentando a sua atividade funcional. Outros activadores, como o A23187 e a tapsigargina, actuam aumentando os níveis de cálcio intracelular, o que pode ativar cinases dependentes do cálcio que fosforilam proteínas nas vias relacionadas com a USP36.
O 12-miristato 13-acetato de forbol (PMA) e o cloreto de queleritrina actuam através da via da proteína quinase C (PKC), alterando o estado de fosforilação das proteínas relacionadas com a USP36(continuação do texto) e influenciando assim a sua atividade. Apesar de terem efeitos opostos na PKC, ambos os compostos podem afetar a atividade da USP36 através da sua influência no estado de fosforilação de proteínas dentro da mesma via. A genisteína impede a desfosforilação de proteínas nas vias em que o USP36 opera, aumentando assim a sua atividade. Por último, o L-NAME aumenta a ativação da PKA e aumenta a fosforilação das proteínas das vias relacionadas com a USP36, reduzindo os níveis de óxido nítrico, uma molécula conhecida por inibir a PKA.
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