A ativação molecular da UPRT depende de uma rede complexa de vias de sinalização, em que várias pequenas moléculas podem desempenhar papéis fundamentais. Os compostos que aumentam os níveis intracelulares de AMP cíclico (AMPc) são particularmente influentes, uma vez que o AMPc actua como um segundo mensageiro que ativa proteínas cinases como a PKA. Quando activada, a PKA pode fosforilar várias proteínas, incluindo potencialmente a UPRT, aumentando assim a sua afinidade para os substratos e reforçando a sua atividade enzimática. Do mesmo modo, a inibição das fosfodiesterases por determinadas moléculas pode impedir a degradação do AMPc e do GMP cíclico, conduzindo à sua acumulação no interior das células e à subsequente ativação de vias que aumentam a atividade da UPRT. Os análogos do AMPc permeáveis às células estimulam diretamente estas vias, potenciando ainda mais a atividade da PKA. Além disso, a inibição das proteínas tirosina fosfatases por determinados compostos de vanádio conduz a um aumento global da fosforilação das proteínas, o que também pode afetar o estado de fosforilação e a atividade da UPRT.
Outros activadores actuam modificando o ambiente celular mais vasto em que a UPRT funciona. A ativação da proteína quinase activada por AMP (AMPK) por análogos específicos de nucleótidos tem impacto em várias vias metabólicas e pode aumentar a atividade da UPRT através de efeitos alostéricos ou da fosforilação. A modulação da atividade da GSK-3 ou a alteração dos estados redox celulares através da suplementação de coenzimas essenciais são mecanismos adicionais pelos quais a atividade da UPRT pode ser indiretamente influenciada. Além disso, a ativação da proteína quinase C (PKC) ou a modulação das cascatas de sinalização MAPK podem resultar na fosforilação e ativação da UPRT como parte da resposta celular a diferentes estímulos. Os inibidores da histona desacetilase e certos compostos naturais também podem alterar os padrões de expressão genética, levando potencialmente a uma regulação positiva da atividade da UPRT através de modificações epigenéticas e subsequentes alterações na acessibilidade da cromatina.
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