Os inibidores químicos da SMEK1 incluem uma variedade de compostos que podem interferir com vias celulares específicas, conduzindo indiretamente à inibição funcional desta proteína. O ácido ocadaico e a calicilina A, por exemplo, têm como alvo a atividade das proteínas fosfatases PP1 e PP2A. Ao inibir estas fosfatases, o estado de fosforilação na célula é alterado, resultando potencialmente na hiperfosforilação de proteínas que, de outro modo, seriam desfosforiladas por estas enzimas. Este cenário de fosforilação alterado pode impedir a SMEK1 de interagir com os seus substratos ou de ser corretamente regulada, inibindo assim a sua função.
Além disso, o H-89, como inibidor da PKA, pode alterar a fosforilação de proteínas na via da SMEK1, inibindo assim indiretamente a sua função. A rapamicina, ao inibir especificamente a mTOR, interrompe os complexos mTORC1 e mTORC2, que podem ser essenciais para a localização ou a função reguladora da SMEK1 em determinadas vias de sinalização. O LY294002 e a Wortmannin, ambos inibidores da PI3K, podem impedir a ativação de alvos a jusante nas vias dependentes da PI3K, o que pode ser crucial para a atividade da SMEK1. O U0126 e o PD98059, que inibem a MEK1/2 na via MAPK/ERK, também podem levar à inibição da SMEK1. A triciribina, ao inibir seletivamente a Akt, pode influenciar a SMEK1. A inibição da p38 MAP quinase pelo SB203580 pode influenciar o papel da SMEK1 nas vias de resposta ao stress e a inibição da JNK pelo SP600125 pode afetar a SMEK1.
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