Os inibidores químicos da RSP3 podem exercer a sua inibição funcional através de vários mecanismos que afectam as vias celulares em que a RSP3 está envolvida. A miricetina, por exemplo, tem como alvo a caseína quinase II (CK2), que fosforila uma série de proteínas nas estruturas ciliares. Ao inibir a CK2, a miricetina reduz os níveis de fosforilação, levando à inibição funcional da RSP3. O galato de epigalocatequina (EGCG) actua através da via da fosfoinositídeo 3-quinase (PI3K), que é essencial para a função ciliar. A inibição da PI3K pela EGCG interrompe processos essenciais para a atividade da RSP3, inibindo assim a sua função. Da mesma forma, a daidzeína e a genisteína, como inibidores da tirosina quinase, obstruem a sinalização necessária para várias funções celulares, incluindo as que envolvem o movimento ciliar, onde a RSP3 é crucial. Ao impedir estas cinases, a daidzeína e a genisteína podem suprimir as capacidades funcionais da RSP3.
Além disso, a estatisporina, um inibidor da proteína quinase de largo espetro, pode abafar a atividade da quinase da qual dependem o movimento e a função ciliar, inibindo assim a atividade da RSP3. O sunitinib e o sorafenib, ambos inibidores do recetor tirosina quinase, impedem as vias de sinalização que afectam a dinâmica ciliar, conduzindo indiretamente à inibição do papel da RSP3 nesses processos. O GW5074, um inibidor da Raf kinase, tem impacto na via MAPK/ERK, associada à montagem e desmontagem ciliar, afectando assim a funcionalidade da RSP3. O lapatinib, que tem como alvo as quinases EGFR, interrompe as vias de sinalização que são cruciais para manter a estrutura e a função ciliar, onde a RSP3 opera. A cantharidina inibe as serina/treonina fosfatases como a PP1 e a PP2A, cuja atividade está ligada à função ciliar, e ao inibir estas fosfatases, o papel da RSP3 é indiretamente inibido. O ZD6474 (Vandetanib) e o ibrutinib, ambos inibidores da tirosina quinase, afectam as vias de sinalização que regulam a dinâmica e a estrutura ciliar, inibindo assim indiretamente o papel funcional da RSP3 na arquitetura ciliar.
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